A diferencia de la cocoa que se vende en otras partes del mundo, el chocolate mixqueño no contiene productos químicos para preservarlo. Puede durar un año en buen estado, aunque hay quienes recomiendan no guardarlo por más de tres o cuatro meses porque cambia el sabor. Es mejor almacenarlo en un lugar fresco y en recipiente cerrado.
Se sabe que el chocolate es bueno por el olor, el sabor y la textura. Uno de calidad, deja la taza impregnada con los residuos cafés del líquido.
Para preparar la bebida, se agregan las tabletas o las barras al agua al momento de ponerla al fuego. Se mueve constantemente hasta que el chocolate se disuelve, con el primer hervor se retira.
Para preparar una bebida espumosa y con el agradable sabor que lo caracteriza, se recomienda que a 10 tazas de agua se le agregue una libra de chocolate. Si es sólo una la que se va a preparar recomienda echarle media rueda del producto. Si se le quiere agregar leche debe ser en proporciones iguales con el agua.